Как потерять УСН, не превысив ни одного лимита

Большинство предпринимателей на УСН держат в голове две цифры: доход и численность сотрудников. Пока обе в пределах лимита — можно жить спокойно. Но практика арбитражных судов 2025–2026 годов показывает, что упрощёнку можно потерять и без формального превышения этих цифр, например, из-за структуры бизнеса. Разберем недавний прецедент.

Что грозит при утрате права на УСН

Если применение УСН не соответствует условиям законодательства, и это через два года при выездной проверке обнаружит ФНС, налогоплательщику посчитают налоги по общей системе налогообложения задним числом, начиная с месяца такого несоответствия (до 2025 года с квартала). За весь период с этого момента доначисляют НДС, для организаций налог на прибыль, для ИП НДФЛ, налог на имущество, от которого налогоплательщик был освобожден в связи с применением УСН (плательщики УСН платят налог на имущество, который исчисляется с кадастровой стоимости). Именно поэтому «неочевидные» основания для утраты права так болезненны, потому что налогоплательщик годами считает, что применяет спецрежим законно. (п.4, ст. 346.13 НК РФ)

Обособленное подразделение, которое суд счел филиалом

Наличие филиала прямо закрывает дорогу к УСН: «организации, имеющие филиалы» не вправе применять упрощённую систему налогообложения (пп. 1 п. 3 ст. 346.12 НК РФ). А вот обособленное подразделение, не являющееся филиалом (таковым может быть дополнительный офис или точка продаж) для УСН подходит.

Признаки филиала исходя из ст. 55 ГК РФ — внесение сведений о нем в ЕГРЮЛ и наличие положения о филиале, также должен быть назначен руководитель филиала. Если данные условия не соблюдаются, то с формальной точки зрения филиала нет и можно применять УСН.

Дело кооператива «ТЭК» показало, что для налоговых целей это рассуждение не работает: суд оценивает фактическую деятельность обособленного подразделения, и даже в отсутствие записи в ЕГРЮЛ, положении о филиале может сделать вывод о его наличии.

Арбитражный суд Московского округа обнаружил что у челябинского подразделения кооператива «ТЭК» есть подразделение и указал у него следующие признаки филиала:

1. Подразделение занималось той же деятельностью, что и головной офис, а не вспомогательной работой;
2. Клиенты организации взаимодействовали преимущественно с челябинским подразделением;
3. Фактическое обслуживание пайщиков, включая оформление сделок и выполнение иных юридически значимых действий, осуществлялось через обособленное подразделение в Челябинске;
4. Подразделение находилось в другом городе, а не там, где зарегистрирована сама организация;
5. В обособленном подразделении были постоянные рабочие места, и там же работало больше 70% всех сотрудников кооператива;
6. арендованное помещение оказалось даже больше, чем в головном офисе.

Сложив все эти факты, суды решили, что перед ними — филиал по смыслу статьи 55 ГК РФ, а раз так, то по нормам Налогового кодекса (пп. 1 п. 3 ст. 346.12 НК РФ) кооператив не имел права применять упрощённую систему налогообложения.. . . . .

Верховный Суд РФ спор пересматривать не стал: определением от 03.06.2026 № 305-ЭС26-5241 в передаче дела в Судебную коллегию по экономическим спорам отказано. Позиция устояла на самом высоком уровне.

Какие делаем выводы

Дело показало, по каким признакам сейчас подразделение компании рискует превратиться в филиал в глазах суда. Основных признаков 2:

1. Подразделение выполняет не вспомогательные, а те же функции, что и головной офис (дословная формулировка ч.2 ст. 55 ГК РФ: «Филиалом является обособленное подразделение юридического лица, расположенное вне места его нахождения и осуществляющее все его функции или их часть»)
2. Подразделение находится не там, где зарегистрирована головная организация

Налоговые консультации АКГ «Капитал» помогают выстроить правильный баланс между налоговыми нагрузками и рисками.

Актуальные на 2026 год условия для применения УСН

(п. 3 ст. 346.12, п. 4 ст. 346.13 НК РФ, с учетом коэффициента-дефлятора):

1. доход за год — не более 490,5 млн руб.;
2. остаточная стоимость основных средств — не более 218 млн руб.(пп. 16 п. 3 ст. 346.12 НК РФ);
3. средняя численность работников — не более 130 человек;
4. отсутствие филиалов у организации (пп. 1 п. 3 ст. 346.12 НК РФ)